Когда Кэяру получил способность исцелять любого независимо от серьезности ран, казалось, что его ждет великое будущее. Но вместо этого он годами подвергался адским пыткам и издевательствам. Исцеляющие навыки Кэяру позволяли ему тайно собирать воспоминания и способности тех, кого он лечил, и постепенно делали его сильнее.
Аниме «009: Возвращение киборга» переносит историю в 2013 год, когда сразу несколько крупнейших городов мира переживают разрушительные атаки. Лондон, Москва, Берлин и Нью-Йорк оказываются охвачены паникой после взрывов и падения небоскребов, а привычные механизмы безопасности не дают быстрого ответа, кто стоит за происходящим.
Деревенька Сотоба, затерянная в японской горной глуши, и в конце XX века не сдается наступающей цивилизации. Да, старики уходят, а некоторые молодые, как десятиклассница Мэгуми, мечтают сразу после школы сбежать в мегаполис. Но есть и другие — 32-летний Тосио Одзаки вернулся на родину и возглавил сельскую клинику, а семья Нацуно переехала из города поближе к природе.