Мицуко Амано работает с искусственным интеллектом и хочет понять, возможна ли рядом с людьми не просто полезная машина, а полноценное присутствие андроида в обычной среде. Для эксперимента она отправляет Сион в школу своей дочери Сатоми. Робот должна вести себя как простая девочка-подросток, не выдавать свою природу и незаметно вписаться в школьную жизнь.
Наоми Катагаки живёт в Киото 2027 года и больше привык к книгам, чем к решительным поступкам. Он стесняется говорить в классе, держит чувства при себе и не представляет, как подойти к однокласснице, которая ему нравится. Его осторожная повседневность ломается после странного явления в небе, вороны с украденной книгой и искривления пространства.