Джейсон Борн хотел лишь одного — исчезнуть и попытаться жить нормальной жизнью с девушкой Мари. Поселившись в Индии, он надеялся, что опасность позади, но высшие чины ЦРУ в попытках замести следы своих грязных дел продолжают охоту на бывшего агента. Когда Джейсон замечает очередного спеца из агентства, он вместе с Мари решает бежать, чтобы разобраться с прошлым раз и навсегда.
1928 год. Египет. Археолог находит странное сооружение. Через много лет уже в наше время его дочь привлекает молодого специалиста Джексона для разгадки тайны, над которой бьются ученые на военной базе в горах. Таинственное сооружение оказывается проходом в другие миры. С группой спецназа Джексон и полковник отправляются через звездные врата навстречу неизведанному.