Аниме «Тетрадь дружбы Нацумэ» переносит в мир Такаси Нацумэ, юноши, который с детства видит духов и вынужден скрывать этот дар от обычных людей. Его жизнь всегда проходила на границе двух реальностей: человеческой, где слишком легко показаться странным, и потусторонней, где каждое существо может прийти с просьбой, угрозой или старой обидой.
Такаси Нацумэ может видеть духов и прочую нечисть. Парень часто переезжал с места на место в надежде найти покой. Поселившись в доме своей умершей бабушки, Такаси находит её дневник с описанием борьбы с силами тьмы.
В том, что в тихом омуте черти водятся, юному Кэйити пришлось убедиться на своём собственном опыте. Переехав с родителями из города в живописную деревушку Хинамидзаву и подружившись в маленькой местной школе с очаровательными одноклассницами, он даже не подозревал, насколько обманчиво его представление об этом безмятежном крае и его обитателях.
События происходят в вымышленной школе святой Лилианы, основанной в 1902 году в Мусасино. В этой школе существует «система сестёр» — старшие должны опекать младших, как своих сестёр. Совет школы здесь носит название Ямаюрикай, он состоит из трёх старших учениц, носящих имена-титулы Роз: Роза Хиненсис, Роза Фетида и Роза Гигантея. Младших Сестёр трёх Роз называют «бутонами».
После смерти родителей Маугли воспитывается волчьей стаей из леса Сиони во главе с Акелой и другими дикими животными, такими как Багира и Балу. Молодой мальчик проходит через несколько трогательных, горько-сладких и опасных для жизни приключений, когда он ищет свою истинную цель в жизни. И одна из многих опасностей, с которыми ему приходится сталкиваться,-это тигр-людоед Шер Хан...