«Обитель зла: Мутация» строит фантастический триллер вокруг Элли, девушки, которую десять лет назад удочерила пара богатых биотехнологических предпринимателей. Снаружи ее жизнь может казаться привилегированной: дизайнерский особняк в Малибу, обеспеченные родители и все условия для безопасности. Но накануне 16-летия Элли чувствует не радость, а одиночество.
Уже 10 лет Земля захвачена пришельцами. Часть населения сотрудничает с оккупантами, но часть в подпольном сопротивлении ведет борьбу. У главы полиции Чикаго есть всего 24 часа, чтобы поймать лидера повстанцев Феникса.