Аниме «У Коми проблемы с общением» начинается в школе, где учатся самые разные ребята, яркие характеры и люди с необычными привычками. Среди них особенно выделяется Сёко Коми: красивая, сдержанная и почти недосягаемая в глазах одноклассников. Многие считают ее идеальной и загадочной, но за этим образом скрывается серьезная трудность в общении.
Брошенный своей девушкой студент Кадзуя пытается заполнить пустоту в сердце с помощью арендованной подруги из мобильного приложения. Поначалу Тидзуру кажется идеальной — она красивая, милая и заботливая. Однако, увидев неоднозначные отзывы в её профиле, Кадзуя решает, что Тидзуру просто играет с мужчинами, и ставит ей плохую оценку. Рассерженная девушка показывает свою истинную сущность.
В Токио участились случаи самовозгорания. Причины этого феномена неизвестны, и люди не умирают, а превращаются в огнелюдей — безмозглых монстров, которые становятся причиной ещё больших пожаров. Для борьбы с ними созданы пожарные отряды, которые ещё и пытаются выяснить, из-за чего это всё происходит. К такому отряду присоединяется Синра Кусакабэ.
Ещё младенцами в один и тот же день Аста с Юно были подброшены под двери церкви одной отдалённой деревни. Годы шли, мальчики росли, а миром вокруг них правила магия. Юно оказался по-настоящему одарённым чародеем, а Аста не мог освоить и простейшее заклинание. На пятнадцатый день рождения юноши получат свою собственную книгу заклинаний — гримуар.