После событий первой части защитники Земного царства подходят к настоящему испытанию. Теперь речь уже не только о подготовке отдельных бойцов и поиске тех, кто способен выдержать смертельный поединок. В битву входит Джонни Кейдж, самоуверенная звезда боевиков, которой предстоит столкнуться с миром, где удары, магия и древние правила не имеют ничего общего с киношной славой.
Император Внеземелья Шао Кан прибывает на Землю, чтобы лично предупредить ее жителей о своих намерениях уничтожить мир земной и сделать все это за семь библейских дней. В числе его подручных — роботы, обладающие инстинктами и приемами ниндзя, четырехрукая дева Шива и звероподобный человек Мотарро. Но им противостоят герои Земли во главе с самим лордом Рейденом.
Чтобы захватить наш мир, колдун Шан Цзун проводит бойцовский турнир Mortal Kombat, где сражаются лучшие из лучших. Здесь дерутся на смерть, а у проигравших колдун забирает душу. В решающей битве за судьбу Земли участвуют китаец Лю Кан, брат которого погиб на предыдущем турнире от руки Шан Цзуна, звезда боевиков Джонни Кейдж и следователь Соня Блейд, преследующая преступника Кэно, убившего её...