Resident Evil: Death Island собирает несколько линий расследования в одном зараженном узле. Леон С. Кеннеди ищет похищенного ученого, Джилл Валентайн и Крис Редфилд разбираются со вспышкой T-вируса в Сан-Франциско, а Клэр Редфилд выходит на странный след после гибели кита в заливе. Сначала их дела выглядят разрозненными, но постепенно все указывает на Алькатрас.
Джин, Хана и Миюки живут на улицах Токио и знают город с той стороны, которую многие предпочитают не замечать. Джин давно скитается и борется с зависимостью, Хана сохраняет демонстративную яркость и мечту о семейном тепле, а Миюки сбежала из дома и пытается держаться жёстко, чтобы не показывать уязвимость.