Шафран. Часть 2 обращается к одной из самых болезненных страниц колониальной истории Индии. В центре фильма - адвокат Санкаран Найр, который решает не молчать об Амритсарской бойне и вступает в юридическую борьбу против Британской империи. Его оружие не армия и не подпольная месть, а закон, публичное слово и настойчивое требование признать жестокость произошедшего.
Стивен Недумпалли ведёт двойную жизнь как Кхуреши Абраам — неуловимый глава влиятельной международной преступной группировки. Он вынужден вернуться в Индии, чтобы спасти свой штат и помочь Зайеду, своему главному соратнику, отомстить.
1930-1940-е годы, Тамилнад. Аналисан, деревенский житель, вступает в Британскую индийскую армию. Британцы, которые не могут выговорить местное имя, зовут его Миллером, а сам новобранец гордо называет себя капитаном Миллером. Однажды, став свидетелем зверств колониальной армии, капитан Миллер дезертирует и присоединяется к повстанцам, которые борются с британцами.
Британская Индия. Рама — преданный полицейский на службе у колониального правительства, способный расправиться с толпой в одиночку, и местные считают его предателем. Бхим — парень из племени гондов, который вынужден отправиться в Дели на поиски похищенной губернатором маленькой соплеменницы. Узнав об этом, губернатор объявляет награду за его поимку, и, чтобы продвинуться по службе, Рама...